真菌與細菌、病毒同屬於微生物，分成酵母菌、黴菌與蕈類。相對於原核類的細菌，真菌同樣被稱為「菌」，但在細胞結構上，屬於真核類，因為它們具有真正的細胞核與核膜，核內可以找到染色體，並能進行有絲分裂；細胞質裡有產生能量的粒線體及許多微管構造，遠比原核類生物複雜；原核類生物沒有細胞核膜和粒線體等胞器。因此，雖然同被稱為「菌」，實際上從演化與分類地位來看，真菌與細菌是完全不同的生物。 真菌絕大部份是由絲狀體(菌絲)所構成。絲狀體組成菌絲體。菌絲多呈管狀(直徑在0.01毫米以下)。部份真菌的菌絲有橫隔壁把菌絲分為類似細胞的單元，但每個「細胞」卻有一至數個細胞核，且隔壁上有小孔，容許細胞質通過，所以與普通細胞有所分別。一些較低等的真菌則不具橫隔壁。真菌的菌絲具細胞壁，成份多為幾丁質(chitin)，而非如植物細胞是由纖維素構成。還有真菌的菌絲不含光合作用色素，所以真菌是不能夠進行光合作用，而是以腐生或寄生方式生活。菌絲或由菌絲形成的吸器可以分泌消化液，將與其接觸的食物分解，然後吸收。真菌可進行無性生殖及有性生殖。無性生殖可透過菌絲體斷裂，細胞分裂(像酵母菌的單細胞真菌)及孢子生殖(像霉菌)來進行。有性生殖則通過性細胞的結合來完成。高等真菌(像蕈菌)的有性生殖是在一個叫子實體的結構裏發生。例如，我們平常食用的草菇這種真菌的子實體。其他例子還有冬菇、竹蓀、木耳、靈芝等。這些食用菌都是它們所屬真菌的子實體。經過性細胞融合後，這些子實體裏會產生很多有性孢子，進一步增強這些真菌的繁殖及傳播能力。真菌有各種分類方式。以體型來說，小的有肉眼看不到僅數微米大小的酵母菌，而大的則有直徑達數公尺的大型多孔菌。一般的分類法係依據安斯沃思（Ainsworth，1971、1973）的分類系統，在真菌界下設立兩門：粘菌門和真菌門。各門又下分數綱： 粘菌門：
真菌門：
牛樟芝在分類上，屬於：真菌界，真菌門，擔子菌綱，同擔子菌亞綱，非褶菌目，多孔菌科，薄孔菌屬，樟芝種。
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